Décrit initialement sous Fundulus oaxacae:
- Meek, Seth Eugene. 1902. "A contribution to the ichthyology of Mexico". Field Columbian Museum Publication. 3(6):63-128 (ffm00269)
Conservation: Profundulus oaxacae n'est pas évalué par l'Union Internationale pour la Conservation de la Nature dans la Liste rouge des espèces menacées.