Décrit initialement sous Characodon variatus:
ZooBank:A36CE0A2-4AA1-4DD0-A7CB-0103CE339581.
- Bean, Tarleton Hoffman. 1887. "Descriptions of five new species of fishes sent by Prof. A. Dugès from the Province of Guanajuato, Mexico". Proceeding of the United States National Museum. 10(637):370-375 (ffm04505)
Conservation: Xenotoca variata est évalué par l'Union Internationale pour la Conservation de la Nature dans la Liste Rouge des espèces menacées comme étant (LC) préoccupation mineure (2019).